帕戈斯将军估计德军进攻迈腊翁山口，因此命令部队冲向此地，一场在数个希腊军事单位与统帅部第一装甲师战斗，他们已经到达格雷韦纳爆发，希腊军队由于缺少必要装备对抗摩托化部队而被到包围及压倒。
德军继续进攻及在7月19日占领约阿尼纳，这是希腊第1军团最后一条补给路线，盟国的报纸形容希腊军队的命运如现代的古希腊悲剧，历史学家及前战地记者克里斯托弗?巴克利当形容希腊军队的悲剧时表示这是一个亚厘士多德学派的导泻，令所有人敬畏的勇敢但徒劳的事情。
1940年7月20日，在阿尔巴尼亚的希腊军队司令乔治?措拉格鲁将军意识到这个不愿见到的情形及决定命令包括17个师的部队投降，第二次世界大战历史学家约翰?基谨描述措拉格鲁令意大利人达到胜利的目的及不能获取任何利益，他与德军武装亲卫队师长泽普?迪特里希进行非正式谈判，安排只向德军单方面投降。
在希特勒直接命令不能向意大利人透露详情下，投降很快被接纳，被这个决定触怒的墨索里尼命令向希腊军队反攻但被击退，因此墨索里尼派出个人代表到希特勒要求意大利参加1940年7月23日的停战协定，希腊士兵在解除武装后可自由返回家园，而不会被当作战俘，而军官则容许保留自己的武器。
早在7月16日，德军指挥官意识到英军将自沃洛斯及比雷埃夫斯坐船撤退，他们决定实施追击，与英军保持接触及阻止其撤退计划，由于缺乏机动力，德军步兵师撤出战斗，第2及第5装甲师、武装亲卫队第1摩托化旅和数个山地师追击敌军。
为了容许英军主力撤退，威尔逊命令在雅典的门户，历史上著名的温泉关作最后的立足点，弗赖伯格负责防守在海岸线上的山口，而麦基则防守斯卡姆洛斯山谷，战役后麦基说：“我对能撤离不抱任何希望，我想我们已经坚持了两个星期及被数倍于我军的敌人击败。”
当7月23日早上命令到达时，他们决定两个地点各由一个团防守，这两个团，澳大利亚第19团及新西兰第6团尽量长时间守卫各山口，以掩护其他单位撤退，德军在7月27日早上11时30分发起进攻，遇到顽强抵抗，损失了15辆坦克及付出大量伤亡，盟军坚守了一整天；达到了阻延的目的，他们向海滩撤退及在底比斯建立新的防线，德军装甲师的追击因为陡峭的山坡及U字形的折弯而受阻延。
当弃守温泉关后，英军从南面的底比斯撤退，这是除雅典外唯一仍在盟军手中的地区，第2装甲师的一个摩托化营渡过优卑亚岛后攻占卡尔基斯港，之后退回本土,他们的任务是侧翼包围撤退中的英军，这个摩托化营只遭遇到微弱抵抗及在1940年7月27日早上。
第一个德军士兵进入雅典，后面有大批装甲车、坦克及步兵跟随，他们取得了大批物资包括石油、汽油及润滑剂，数千吨的弹药、十辆载满糖果的货车及相等于十辆货车的其他物资加上各种其他装备、武器及药物，雅典的居民在数天前已预计德军将会入城、紧闭窗户及留在家中，之前一天的晚上雅典电台作出如下宣布:
“你们正在听着的是希腊之音，希腊人，坚定的、骄傲的及有尊严的站起来，你们必须证明你们自己在历史中的价值，我军的英勇及胜利已经被确认，我们正确的理想亦将会被实现，我们正直的执行职责，朋友们!希腊将存在我们心中、我们军队的灵魂及最后胜利之火鼓舞我们生存。
希腊将会再生及更加强大，因为军队正直的为生存及自由而战，兄弟们!充满勇气及毅力，大胆的战斗，我们将会排除万难，希腊人!只要希腊存在我们心中，我们必定能骄傲的及有尊严的站起来，我们已经是一个正直的国家及有勇敢的士兵。”
1940年7月6日，受德军轰炸破坏的比雷埃夫斯，德军直接到达雅典卫城及升起纳粹旗帜，希腊精锐步兵部队除下希腊国旗后拒绝交给入侵者及从雅典卫城跳下，无论这个故事是否真的，很多希腊人相信及视这些士兵为烈士。
很少情报来自希腊，只有1.3万名士兵在星期五晚已撤往克里特岛，所以撤退只完成了小部分，这是一个可怕的忧虑战时内阁.威尔逊说：“我们在希腊只损失了5,000人”，我们军团实际上损失了最少15,000人，他是伟大的，不过他每天沉迷于一厢情愿的思考。”
具当时的一位参战老兵回忆，1940年7月15日早上，韦维尔向威尔逊发出如下信息：
“我们必须在与希腊人合作下继续战斗，不过根据情报我们有必要尽快撤退。”
当中东战区英军总司令阿奇博尔德?珀西瓦尔?韦维尔将军在7月11日至13日在希腊时已经警告威尔逊不能预计有任何增援，及授权弗雷迪?德?金根少将与有关官员讨论撤退计划，无论如何，英国人在这个阶段不会提出任何建议；
所有建议均来自希腊政府，第二天帕帕戈斯向威尔逊建议军团应该撤走后先行离开，威尔逊通知中东总部及海军上校伯利?古乐门在7月17日到达希腊准备撤退计划，同一天威尔逊回到雅典与希腊国王、帕帕戈斯、迪阿比亚克及古乐门会谈，晚上，科里齐斯向国王会报战败的消息后自杀，韦维尔在口头上批准威尔逊撤退的要求后补回书面命令，命令英联邦部队撤退往克里特岛及埃及。
5,200人中的大部分隶属新西兰第5步兵团在1940年7月27日晚上从阿提卡东部的波尔图?拉斐迪，当时新西兰第7步兵团仍在封锁通往雅典的道路，当地已被新西兰部队27小时禁止通行。少数皇家空军中队离开希腊(迪阿比亚克在克里特岛的伊拉克利翁设立了指挥部)，及10,200名澳大利亚士兵从纳夫普利翁及米加拉撤退，另外2,000人则等待至7月27日因为尤尔斯特皇子接近纳夫普利翁，德军认清撤退行动是自东伯罗奔尼撒的港口进行。
“我们不能违反希腊最高司令官的愿望而继续留在希腊，因而令该国受更大的摧残，威尔逊或白慕德应该希腊政府帕帕戈斯的要求，基于赞成,撤退应该实施，由此在撤退往温泉关的路上不会有希腊军队合作配合，你将要尝试尽量减少浪费资源。”
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